«Затоплялись» - ударение в слове
В таком слове ударение ставят на слог с буквой Я — затоплЯлись.
затоплЯлись.
Затоплялись - образовано от слова затопляться (о береге)
Примеры
В конце последнего ледникового периода, когда в Сибири еще сохранились мамонты, длинношерстные носороги, первобытные быки и уже существовал первобытный человек, эта северная окраина Сибири начала разбиваться большими разломами и отдельные участки ее опускались и затопля́лись морем. — Владимир Обручев, Плутония. Земля Санникова