«Запротоколирует» - ударение в слове
В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой И — запротоколИрует.
запротоколИрует.
Запротоколирует - образовано от слова запротоколировать
Примеры
Судья либо перенесёт рассмотрение дела на другую дату, либо запротоколи́рует сказанное. — Татьяна Александровна Тонунц, Защити права своего ребенка! Юридический справочник для родителей. 2020 год