«Вегетацию» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с буквой А — вегетАцию.
вегетАцию.
Вегетацию - винительный падеж слова вегетация
Примеры
В этом случае растения успевают подготовиться к зимовке и своевременно начинают весеннюю вегета́цию, используя почвенную влагу. — А. Н. Продан, Ремонтантная малина и ежевика, 2012