«Транскрипционная» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с буквой О — транскрипциОнная.
транскрипциОнная.
Транскрипционная - образовано от слова транскрипционный
Примеры
Поскольку многие из них состоят из нескольких структурных генов (цистронов), оперон прочитывается как одна транскрипцио́нная единица. — Сергей Бабичев, Медицинская микробиология, иммунология и вирусология, 2010