«Трахеотомией» - ударение в слове
В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой И — трахеотомИей.
трахеотомИей.
Трахеотомией - творительный падеж слова трахеотомия
Примеры
Такое оперативное вмешательство на трахее называется среднейили промежуточной трахеотоми́ей. — В. И. Бабияк, Оториноларингология: Руководство. Том 2, 2009