«Топологиями» - ударение в слове
В указанном выше слове ударение следует ставить на слог с третьей буквой О — тополОгиями.
тополОгиями.
Топологиями - творительный падеж, множественное число слова топология
Примеры
Непрерывное отображение одного пространства в другое необходимо для введения связи в различной форме между подмножествами эгосферы и основными четырьмя (подсистемами эгосферы как динамической системы) соответствующими тополо́гиями. — В. Б. Живетин, Введение в теорию риска (динамических систем), 2009