«Скинией» - ударение в слове
В таком слове ударение падает на слог с первой буквой И — скИнией.
скИнией.
Скинией - творительный падеж слова скиния
Примеры
Когда наступил воскресный день, честное тело преподобной Ксении покрыли чистыми покровами и с пением надгробных песен понесли к месту, находившемуся у входа в город с южной стороны и называвшемуся ски́нией (смоковничьим): там, прежде кончины своей, святая завещала похоронить свое тело. — И. Калинский, Церковно-народный месяцеслов на Руси