«Сепарирование» - ударение в слове
В указанном выше слове ударение ставят на слог с первой буквой И — сепарИрование.
сепарИрование.
Примеры
По содержанию жира нормализуют, добавляя обезжиренное молоко, или проводя частичное сепари́рование молока, или же добавляя к обезжиренному молоку цельное. — Алевтина Корзунова, Молочное чудо, 2013