«Сепаратно» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой А — сепарАтно.
сепарАтно.
Сепаратно - образовано от слова сепаратный
Примеры
Оттого, разумеется, что военное искусство, точно так же, как и всё другое, не может быть усовершенствовано сепара́тно, без всякого отношения к другим предметам управления и жизни народной. — Н. А. Добролюбов, Первые годы царствования Петра Великого, 1858
Оба должны были подписывать отчёты, предоставляемые правительству, так что действовать сепара́тно было затруднительно. — Чарльз Данн, Традиционная Япония. Быт, религия, культура