«Счёт-Фактура» - ударение в слове
В данном слове ударение следует ставить на слог с буквой У — счёт-фактУра.
счёт-фактУра.
Примеры
Основанием для записи операции по расчётному счёту являются: выписка с р/с, платёжное поручение и счёт-факту́ра. — Д. А. Шевчук, Бухучет, налогообложение, управленческий учет: самоучитель