«Подсистемой» - ударение в слове
В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой Е — подсистЕмой.
подсистЕмой.
Подсистемой - творительный падеж слова подсистема
Примеры
Являясь подсисте́мой более сложной системы – общества, наука испытывает на себе определённое воздействие последней, хотя она развивается по своим собственным законам. — П. А. Баранов, Обществознание. Полный справочник для подготовки к ЕГЭ, 2009
В связи с этим финансовая система государства является существующей объективно подсисте́мой государственного управления. — Сергей Викторович Загородников, Финансы и кредит. Курс лекций, 2009