«Побаливали» - ударение в слове
В данном слове ударение следует ставить на слог с первой буквой А — побАливали.
побАливали.
Побаливали - образовано от слова побаливать
Примеры
У отца Ральфа поба́ливали ноги и спина, давным-давно он так много не танцевал, хоть и гордился тем, что следит за новейшими причудами моды. — Колин Маккалоу, Поющие в терновнике