«Перегнили» - ударение в слове

Главная задача компостирования — это создание благоприятных условий для того, чтобы все органические и растительные отходы быстро перегни́ли без потерь. — Т. Ф. Плотникова, Удобряем и подкармливаем с умом, 2013

А если точнее, гумус — это вся органика почвы, за исключением живых организмов или их остатков, которые ещё сохранили своё строение, проще говоря, не перегни́ли. — Наталья Герасимова, Плоскорез Фокина! Вскопать, прополоть, прорыхлить и скосить за 20 минут, 2015

Высаживать растения на таком участке можно в том же году, проделав дырки в картоне или плёнке, но лучше подождать до следующего, чтобы перегни́ли все слои. — Е. Ю. Вечерина, Большая энциклопедия дачника, 2013