«Патриархией» - ударение в слове
В данном слове ударение падает на слог с последней буквой И — патриархИей.
патриархИей.
Патриархией - творительный падеж слова патриархия
Примеры
За патриархи́ей и митрополиями сохранялось право разрабатывать и утверждать программы национальных училищ, которые освобождались от ежегодной правительственной проверки; донесения правительственных инспекторов согласовывались с церковной властью. — Л. А. Герд, Константинопольский Патриархат и Россия. 1901–1914, 2012
Очень часто от музейного «генералитета» и связанной с патриархи́ей интеллигенции можно услышать мнение, что все описанные проблемы есть не что иное, как «болезнь роста». — А. Е. Мусин, Церковная старина в современной России, 2010
Такие выпады использовалась патриархи́ей как доказательство невменяемости своих оппонентов и необоснованности отказа в передаче бывшей церковной собственности, вызванного неприязненным отношением к религии. — А. Е. Мусин, Церковная старина в современной России, 2010
Современный монастырь построен латинской патриархи́ей в 1925 г. — Сборник статей, Иерусалимский православный семинар. Выпуск 4, 2013