«Патогенную» - ударение в слове
В данном слове ударение ставят на слог с буквой Е — патогЕнную.
патогЕнную.
Патогенную - образовано от слова патогенный
Примеры
Он подавляет патоге́нную флору и не даёт развиваться вредным микроорганизмам. — Григорий Михайлов, Три великих целителя: имбирь, хвоя, мумие, 2014
Мальчику была проведена серия инъекций всё более ядовитого вещества, причём последняя инъекция содержала уже полностью патоге́нную форму возбудителя. — Коллектив авторов, Общая вирусология с основами таксономии вирусов позвоночных, 2012