«Организмом» - ударение в слове
В упомянутом выше слове ударение следует ставить на слог с буквой И — органИзмом.
органИзмом.
Организмом - творительный падеж слова организм
Примеры
А ведь это не водевиль, а картинка передвижной выставки: ведь это приговор над живым органи́змом; это все равно что вертеть ножом в теле человека. — Федор Достоевский, Дневник писателя
Это память гигантского, невообразимого объема закодирована органи́змом для работы в области подсознательного. — Иван Ефремов, Лезвие бритвы
В этих условиях бактериальные фильтры, выработанные органи́змом в биологической эволюции, становились своей противоположностью, воротами инфекции, как, например, миндалины горла, синусы лица или лимфатические узлы. — Иван Ефремов, Час Быка
Слух его чрезвычайно обострился; свет он ощущал всем своим органи́змом, и это было заметно даже ночью: он мог отличать лунные ночи от темных и нередко долго ходил по двору, когда все в доме спали, молчаливый и грустный, отдаваясь странному действию мечтательного и фантастического лунного света. — Владимир Короленко, Слепой музыкант
Я поступил благородно и ради собственного ослепления страсти не пожертвовал юным органи́змом ребенка. — Надежда Тэффи, Ведьма