«Нуклонами» - ударение в слове
В таком слове ударение должно быть поставлено на слог с буквой О — нуклОнами.
нуклОнами.
Нуклонами - творительный падеж, множественное число слова нуклон
Примеры
Каждый нуклон ядра взаимодействует не со всеми нукло́нами, а только с несколькими соседними. — Анатолий Трутнев, Физика пространства
Фотоны вклиниваются в щели между нукло́нами, и испускаемой ими энергией (эфиром) раздвигают, разрушают, расщепляют. — Татьяна Данина, Пересмотр науки