«Нагноится» - ударение в слове
В таком слове ударение ставят на слог с буквой И — нагноИтся.
нагноИтся.
Нагноится - образовано от слова нагноиться
Примеры
Пусть ересь нагнои́тся, пусть выйдет на поверхность, как нарыв. — Терри Пратчетт, Мелкие боги