«Морфонема» - ударение в слове
В данном слове ударение следует ставить на слог с буквой Е — морфонЕма.
морфонЕма.
Примеры
Для обозначения ряда чередующихся фонем их вариантов в составе одной морфемы есть термин «морфоне́ма». — Ирина Ивановна Тушева, Элементарно о языкознании. Конспективное изложение, 2020