«Микроструктурой» - ударение в слове
В упомянутом выше слове ударения ставят на слог с буквой И и на слог с последней буквой У — мИкроструктУрой.
мИкроструктУрой.
Микроструктурой - творительный падеж слова микроструктура
Примеры
Один – мир психофизиологии, нейронов, тончайшей биохимии и электродинамики мозга, другой – мир смыслов (аналогичное противостояние наблюдается, к примеру, между ми́крострукту́рой генетического кода и макроструктурой биосистем). — Андрей Пелипенко, Избранные работы по теории культуры, 2014
И когда американцы анализировали движки с «МиГ-29», они были поражены ми́крострукту́рой дендритной ячейки наших лопаток: расстояние между дендритами было в четыре раза меньше, чем в их лопатках. — Максим Калашников, Прорваться в будущее. От агонии – к рассвету!, 2014