«Малахитами» - ударение в слове
В данном слове ударение падает на слог с первой буквой И — малахИтами.
малахИтами.
Малахитами - творительный падеж, множественное число слова малахит
Примеры
Под правой рукой расположился железный клинок, инкрустированный малахи́тами и аметистами. — Елена Витальевна Пономарева, Карты миров. Дети Соловорана, 2017