«Магистратур» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с буквой У — магистратУр.
магистратУр.
Магистратур - родительный падеж, множественное число слова магистратура
Примеры
Через год все поменяется — отныне студенты магистрату́р потеряют право на отсрочку; однако тем, кто к тому времени успеет проучиться в магистратуре больше года, позволят ее закончить. — Джон Ирвинг, Молитва об Оуэне Мини