«Кокками» - ударение в слове

Размножаются цианеи простым бинарным делением клеток, распадом колоний, фрагментацией нитей на отдельные участки таллома — гормогонии, способные прорастать в новые талломы, а также гонидиями, ко́кками, планококками. — Н. А. Лемеза, Альгология и микология. Практикум, 2008

Одни бактерии имеют круглую форму — их называют ко́кками (стафилококк, пневмококк, стрептококк, менингококк, гонококк), другие — удлинённую, их называют палочками (дизентерийная палочка, коклюшная, кишечная). — Е. О. Комаровский, ОРЗ: руководство для здравомыслящих родителей, 2016

Факультативно-анаэробные и аэробные микроорганизмы микрофлоры толстой кишки представлены ко́кками, эшерихиями и грибами рода Candida. — Юрий Копанев, Дисбактериоз кишечника у детей

Круглые бактерии называются ко́кками (одна клетка — кокк). — В. Б. Сбойчаков, Микробиология с основами эпидемиологии и методами микробиологических исследований, 2011