«Карбоксильную» - ударение в слове
В указанном выше слове ударение падает на слог с буквой И — карбоксИльную.
карбоксИльную.
Карбоксильную - образовано от слова карбоксильный
Примеры
За точку отсчёта принято брать карбокси́льную группу, так что число «омега» просто говорит вам, на каком месте с другого конца молекулы (положение омеги) вы найдёте первую двойную связь. — Джозеф Меркола, Кето-навигатор, 2018