«Гомункулусами» - ударение в слове
В таком слове ударение ставят на слог с первой буквой У — гомУнкулусами.
гомУнкулусами.
Гомункулусами - творительный падеж, множественное число слова гомункулус
Примеры
Цилиндр с гому́нкулусами уже исчез в проломе и теперь быстро поднимался к зависшему над дворцом дирижаблю. — Евгений Гаглоев, Аграфена и тайна Королевского госпиталя, 2018