«Центрифугировать» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с последней буквой И — центрифугИровать.
центрифугИровать.
Примеры
Суспензию начинают центрифуги́ровать на специальных приборах — центрифугах. — Н. С. Стволинская, Цитология, 2012