«Бинарными» - ударение в слове

Бина́рными по своей структуре являются и сочетания, полученные в результате последовательного членения высказывания. — Н. Д. Арутюнова, Проблемы морфологии и словообразования, 2007

В ориентации храма в пространстве также воплощены определённые противопоставления, которые названы исследователями бина́рными оппозициями. — А. В. Верещагина, Праздники, обряды и таинства в жизни христиан Беларуси, 2009