«Атомарное» - ударение в слове
В таком слове ударение ставят на слог со второй буквой А — атомАрное.
атомАрное.
Атомарное - образовано от слова атомарный
Примеры
Высокая температура сварочной дуги вызывает также диссоциацию (распад) молекул кислорода и азота в атома́рное состояние. — Илья Мельников, Металлургические процессы при сварке, 2012
С другой стороны, им, наверное, так же трудно понять, как обладая неловкими и грубыми пальцами, человек смог приручить электричество, освоить атома́рное строительство материалов и создать нанокомпьютеры, если его органы чувств не позволяют ни ощущать ни видеть мельчайшие частицы. — Алексей Еремин, Гибельной дорогой