«Ампутируя» - ударение в слове
В таком слове ударение следует ставить на слог с буквой И — ампутИруя.
ампутИруя.
Ампутируя - образовано от слова ампутировать
Примеры
Чем должен думать хирург, ампути́руя здоровый орган!?! Потом была повторная операция, удаление второй молочной железы. — Дмитрий Смиркин, 108 рассказов