«Амнистировать» - ударение в слове
В таком слове ударение ставят на слог со второй буквой И — амнистИровать.
амнистИровать.
Примеры
Вместо того чтоб остро, принципиально критиковать нетерпимый поступок, Станкин нам фактически предлагает амнисти́ровать Кавалерчика.
Бельский нагло появился в Думе, стал без доклада ходить к царю, вместе с Иоасафом амнисти́ровать одного за другим врагов Шуйских.