«Аминогруппой» - ударение в слове
В упомянутом выше слове ударения падают на слог с буквой И и на слог с буквой У — амИногрУппой.
амИногрУппой.
Аминогруппой - творительный падеж слова аминогруппа
Примеры
Аминокислоты, доставленные на рибосомы, ориентированы по отношению друг к другу так, что карбоксильная группа одной аминокислоты оказывается рядом с ами́ногру́ппой другой аминокислоты. — Г. И. Лернер, Биология. Полный справочник для подготовки к ЕГЭ, 2009
Также полуацетальная (полукетальная) гидроксильная группа может вступать в реакцию с ами́ногру́ппой другого соединения тогда образуется N-гликозидная связь. — Е. А. Бессолицына, Структурная биохимия